有人以为腹泻必然是胃肠道细菌感染，因而遇到腹泻便用抗菌素治疗.如痢特灵、黄连索、卡那霉素、庆大莓累等。其实腹泻未必就是细菌感染宵肠道。当然，箱乱.痢疾和一部分由大肠杆菌感染的旸炎确实是细菌感染,治疗时常常需应用抗菌药物。但是有时是唆部受凉、过敏或婴儿饮食不当、辅食增加过快过多造成的，这时便没有细菌感染存在。还有些腹泻如婴幼儿秋冬季腹泻，成人和大孩了-夏季“流行性睃泻”和苒菌性旸炎等都不属于通常的细菌感染。婴幼儿秋冬季瞜泻和夏季“流行性腹泻”系病毒感染所引起的，而葙菌性肠炎是由与普通各种细菌特性有效不同的一类瘅菌引起的。既然病因不同，治疗方法就不应该有效相同，应用抗歯药物也无济于事。

通常情况下大旸里面寄生着大量细菌，它们帮助食物发酵。制造某些维生索和对抗外来细菌的授入，因此这些细菌是不致病的.这些细菌的存在是人体生存所必需的。发生不是因细菌原因引起的腹泻时.如果不恰当地用了抗菌药物，那么,抗菌药物必然会作用在人体内正常情况下存在的细菌身上，从而大量杀灭这些细菌。这样不仅对腹泻没有好处，相反还会因体内常在细菌的减少而发生一些问题，比如因失去正常细蒴对外来致病细菌的对抗作用而发生耐药细菌的感染。也就是说,本来用抗菌素想杀灭致病菌，结果反遭到更历苫的细菌的感染，可见这种情况下是不需要用抗菌药物的。

普通抗菌药物主要是针对细菌感染的，对病毒一般无效。到目前为止，对肠道内的病毒还没有一种有效的药物可以杀灭，因此病毒感染时用抗睹药物治疗是无益的。除了可以导致耐药细菌感染外.各种抗歯药物还都有各自的副作用，如恶心、呕吐、食欲下降甚至影响肝脏、肾脏和造血功能，因此不能一腹泻就随便应用抗菌药物。